Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms