Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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RubcnlQ3TD16 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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RubcnlQ3TD16 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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RubcnlQ3TD16 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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RubcnlQ3TD16 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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RubcnlQ3TD16 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RubcnlQ3TD16 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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RubcnlQ3TD16 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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RubcnlQ3TD16 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RubcnlQ3TD16 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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RubcnlQ3TD16 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RubcnlQ3TD16 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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