Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

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Length 525 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp8Q2V6D6 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gbp8Q2V6D6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gbp8Q2V6D6 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp8Q2V6D6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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