Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Nlrp1aQ2LKU9 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Nlrp1aQ2LKU9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Nlrp1aQ2LKU9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Nlrp1aQ2LKU9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Nlrp1aQ2LKU9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Nlrp1aQ2LKU9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms