Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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