Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms