Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms