Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms