Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pate4Q09098 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms