Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NfiaQ02780 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.4□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms