Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms