Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sec23aQ01405 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sec23aQ01405 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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