Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms