Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms