Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Nbr1P97432 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Nbr1P97432 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Nbr1P97432 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Nbr1P97432 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Nbr1P97432 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Nbr1P97432 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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