Protein–RNA interactions for Protein: P86792

Ccl21b, C-C motif chemokine 21b, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21bP86792 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccl21bP86792 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl21bP86792 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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