Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Arf1P84078 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Arf1P84078 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Arf1P84078 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms