Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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