Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms