Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csrnp3P59055 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms