Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CckbrP56481 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CckbrP56481 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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