Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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