Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcanP55066 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
NcanP55066 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NcanP55066 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NcanP55066 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NcanP55066 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NcanP55066 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NcanP55066 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NcanP55066 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NcanP55066 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NcanP55066 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NcanP55066 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NcanP55066 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NcanP55066 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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