Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms