Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc3P49135 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc3P49135 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc3P49135 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc3P49135 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc3P49135 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc3P49135 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc3P49135 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms