Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CskP41241 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CskP41241 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CskP41241 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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