Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.9 ms