Protein–RNA interactions for Protein: P35293

Rab18, Ras-related protein Rab-18, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab18P35293 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Rab18P35293 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Rab18P35293 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab18P35293 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab18P35293 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab18P35293 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab18P35293 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms