Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprmP28828 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprmP28828 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprmP28828 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprmP28828 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprmP28828 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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