Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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