Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aco1P28271 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Aco1P28271 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms