Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms