Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms