Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZfaP23607 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms