Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms