Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms