Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PdgfaP20033 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PdgfaP20033 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PdgfaP20033 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PdgfaP20033 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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