Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms