Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms