Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms