Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Myod1P10085 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Myod1P10085 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Myod1P10085 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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