Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms