Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

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Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt10P02535 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt10P02535 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt10P02535 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt10P02535 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt10P02535 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt10P02535 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt10P02535 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt10P02535 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt10P02535 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt10P02535 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms