Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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