Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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