Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Sp100O35892 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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Sp100O35892 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Sp100O35892 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Sp100O35892 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Sp100O35892 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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