Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Cited2O35740 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Cited2O35740 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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