Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dgcr6O35347 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dgcr6O35347 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms