Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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