Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm4340L7N2C4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm4340L7N2C4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm4340L7N2C4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm4340L7N2C4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4340L7N2C4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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